Keiser Justinianus I, keda tuntakse suurte arhitektuuriprojektide, nagu Hagia Sophia, poolest, tellis selle kiriku ehitamise aastatel 527–536 m.a.j. Algselt nimetati seda Pühakute Sergiuse ja Bakchuse kirikuks ning see austas kahte kristlikku märtrit. Kiriku eripärane kujundus, mille keskseks elemendiks oli kuppel, oli tollal läbimurre ning võis mõjutada ka suurejoonelise Hagia Sophia ehitamist.

Pärast seda, kui Osmanid vallutasid 1453. aastal Konstantinoopoli, muudeti kirik mošeeks, mida hakati nimetama Kucuk Ayasofya Camii ehk Väikese Hagia Sophia mošeeks. Lisati minarett ja usukool. Vaatamata raskustele, nagu maavärinad ja niiskus, ning isegi sõdade ajal varjupaigana toimimisele, jääb mošee ulatuslike taastamistööde tõttu oluliseks ajalooliseks paigaks.
Arhitektuurne ime
Väljastpoolt on Väikese Hagia Sophia mošeeks ehitatud lihtne, kuid elegantne, peegeldades oma aja arhitektuuritehnikaid. Hoone on kaheksanurkne ning seda kaunistab kaheksa sambale toetuv suurejooneline kuppel. Kui lähened, võtab sind vastu võluv siseõu väikese aia ja purskkaevuga, luues rahuliku ruumi, kuhu peatuda ja ümbrust nautida.

Siseküljel avaneb mošee hiilgus. Põhja-, lääne- ja lõunaküljel asuv kahekorruseline kaarsaal on kaunistatud verd antiikse ja punase Synnadicu marmori sammastikega. Need sambad, mis näitavad möödunud sajandite oskust, toetavad kuplit, mis on jaotatud kuueteistkümneks osaks. Kaheteistkümnes kreekakeelses heksametris leiduv raidkiri austab keiser Justinianust, tema abikaasat Theodorat ja püha Sergiust, lisades interjöörile ajaloolise tähenduse.
Lood ja legendid
Väike Hagia Sophia ei ole küll oma suuremast vasteist nii legendaarne, kuid tal on ometi omajagu meeldejäävaid lugusid. Üks legend räägib, et keiser Justinianus, enne kui temast sai keiser, oli süüdistatud riigireetmises. Pühad Sergius ja Bakchus ilmusid keiser Justin I-le unes, kaitstes Justinianuse süütust. Nende sekkumise eest tänulik, andis Justinianus tõotuse ehitada nende auks kirik, mis viis Väikese Hagia Sophia sünnini.

Teine lugu toob esile mošeeks arhitektuurilise tähtsuse, vihjates, et see võis olla prooviväljak suurde Hagia Sophia’sse viimistletud tehnikatele. Kuigi see pole üleloomulik, rõhutab see legend Bütsantsi arhitektuuri uuenduslikku vaimu.
Mošee müüride sees peidetud varanduste sosinad püsivad siiani. Arvatakse, et need peideti Osmanite vallutuse ajal. Kuigi selliste varanduste olemasolu jääb ebakindlaks, lisab legend paigale mõistatuslikkust.