أمر الإمبراطور جستنيان الأول، المعروف بمشروعاته المعمارية الكبرى مثل آيا صوفيا، ببناء هذه الكنيسة بين عامي 527 و536 ميلاديًا. وقد كانت تُسمّى في البداية كنيسة القديسين سرجيوس وباخوس، تكريمًا لشهيدين مسيحيين اثنين. كان تصميم الكنيسة الفريد، الذي يتميّز بقبة مركزية، رائدًا في ذلك الوقت وربما أثّر في بناء آيا صوفيا الكبرى.

بعد أن استولى العثمانيون على القسطنطينية في عام 1453، حُوّلت الكنيسة إلى مسجد، يُعرف باسم Kucuk Ayasofya Camii أو مسجد آيا صوفيا الصغير. تمّت إضافة مئذنة ومدرسة دينية. وعلى الرغم من التحديات مثل الزلازل والرطوبة، بل وحتى استخدامها كمأوى أثناء الحروب، يظلّ المسجد موقعًا تاريخيًا مهمًا بفضل جهود الترميم الواسعة.
من الخارج، يبدو تصميم مسجد آيا صوفيا الصغير بسيطًا لكنه أنيق، ويعكس التقنيات المعمارية لزمنه. المبنى مثمّن الأضلاع، وتعلوه قبة رائعة مدعومة بثمانية أعمدة. وعندما تقترب، يرحّب بك فناء ساحر تحيط به حديقة صغيرة ونُسْبَة مياه، فيخلق مساحة هادئة للتوقف والاستمتاع بالمحيط.

داخلًا، تنكشف روعة المسجد. تمتد أروقة من طابقين على الجوانب الشمالية والغربية والجنوبية، ومزينة بأعمدة رخامية خضراء عنتيك وحمراء من طراز Synnadic. وتدعم هذه الأعمدة، التي تعرض براعة الحرفية لقرون مضت، قبة مُقسّمة إلى ستة عشر قسمًا. وتُضفي كتابةٌ من اثني عشر بيتًا سداسيًا باليونانية تكريمًا للإمبراطور جستنيان، وزوجته ثيودورا، والقديس سرجيوس، لتضيف أهمية تاريخية إلى داخلية المكان.
يتميّز مسجد آيا صوفيا الصغير، رغم أنه ليس أسطوريًا مثل نظيره الأكبر، بحصته من الحكايات المثيرة. يروي أحد الأساطير أن الإمبراطور جستنيان، قبل أن يصبح إمبراطورًا، اتُّهم بالخيانة. ظهر القديسان سرجيوس وباخوس للإمبراطور جستين الأول في حلم، مؤكدين براءة جستنيان. وبفضل تدخّلهما، تعهّد جستنيان بأن يبني كنيسة تكريمًا لهما، مما أدى إلى إنشاء آيا صوفيا الصغير.

تُبرز حكاية أخرى الأهمية المعمارية للمسجد، مشيرةً إلى أنه كان بمثابة ساحة اختبار للتقنيات التي اكتملت في آيا صوفيا الكبرى. ورغم أن هذه الأسطورة ليست خارقة، إلا أنها تسلّط الضوء على روح الابتكار في العمارة البيزنطية.
لا تزال تردُّدات حول كنوزٍ مخبأة داخل جدران المسجد، ويُعتقد أنها أُخفيت أثناء الفتح العثماني. ورغم أن وجود كنوز كهذه يبقى غير مؤكد، فإن الأسطورة تضفي على الموقع إحساسًا بالغموض.